El s-a plâns în 2012 magistraţilor de la Strasbourg că nu a fost tratat corespunzător în timpul detenţiei şi că i-a fost încălcat dreptul la viaţă privată.  Sorin Apostu a reclamat condițiile din detenție din perioada noiembrie 2011 și ianuarie 2012, dar și cele din penitenciarele Gherla și Rahova, unde a fost încarcerat din ianuarie până în martie 2012.

Printre nemulțumiri se numără suprapopularea, încălzirea neadecvată, iluminarea și igiena. Sorin Apostu s-a plâns și de condițiile în care a fost transportat de la Gherla la Rahova, în 12 ianuarie 2012, dar și de faptul că nu a putut vorbi cu avocatul său în penitenciarul Gherla. 

CEDO a fost de acord cu reclamaţiile, dar nu a pedepsit statul român.